由于肺炎球菌有超过 90 种血清型，即使曾患上某一种血清型的感染，亦未必能对其他血清型产生免疫力。因此，如曾经患上侵入性肺炎球菌疾病，应根据其年龄及健康风险按时接种肺炎球菌疫苗。

现在市面上有多于一种的肺炎球菌结合疫苗，但是没有一种疫苗能预防所有血清类型的肺炎球菌。而世卫指出，肺炎球菌结合疫苗所包含的血清型也不一定愈多愈好，因为不同国家流行的肺炎球菌血清型并不一样、不同人口的免疫反应也未必一样。注意个人及环境卫生是同样重要的预防方法。